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中国科学院西北高原生物研究所专利：青藏扁蓿豆EST-SSR遗传标记位点和相应标记引序列及其应用
中国科学院西北高原生物研究所 专利 青藏扁蓿豆 EST-SSR 遗传标记位点 标记引序列
2024/6/27
中国科学院西北高原生物研究所专利：青藏扁蓿豆EST-SSR遗传标记位点和相应标记引序列及其应用。
2022年4月26日，从国家知识产权局获悉，中国科学院武汉植物园药用植物资源学科组的“一种快速鉴定罂粟的SSR试剂盒”获国家发明专利授权。专利号：ZL201910362343.5。发明人：梁琼；杨路路；张燕君；袁芳。
2021年2月10日，从国家知识产权局获悉,中国科学院武汉植物园的发明专利“用于鉴定泰国莲种质的SSR分子标记及应用” （ZL 201911080230.2）获国家发明专利授权。发明人：杨美、杨东、宋贺云、刘艳玲、邓显豹。
基于表型性状及分子标记对丽江不同油橄榄品种进行遗传多样性分析,对品种鉴定及育种工作均有重要意义。以云南丽江主要栽培的19个油橄榄品种为试验材料,利用14个表型性状(5个叶片性状和9个果实性状)及20个SSR引物荧光标记进行多样性及聚类分析。结果表明,各品种油橄榄表型性状存在显著差异,20个SSR位点共检测到124个等位基因变异,平均每个位点等位基因数为6.2个,利用表型性状及SSR荧光分子标记可完...
基于SSR分子标记的酸浆属植物亲缘关系研究
酸浆属 亲缘关系 SSR分子标记
2018/5/21
近年来, 由于营养价值高、果实可当水果食用且具有潜在的药用价值, 酸浆属(Physalis)植物在全球范围内受到了越来越多的关注。采用SSR分子标记技术对我国范围内主要分布的4种酸浆属植物的22份样品进行了亲缘关系研究, 结果表明, 20对SSR引物共扩增出118个位点, 其中107个(90.7%)为多态性位点; 平均种间遗传相似系数为0.501。UPGMA聚类和PCoA分析结果得出相似结论, 并...
龙眼顶芽转录组简单重复序列(SSR)标记信息分析及分子标记开发
龙眼 转录组 SSR
2018/3/29
随着新一代测序技术的发展, 大量的转录组数据和表达序列标签(EST)成为开发简单重复序列(SSR)标记的可利用资源。本研究利用MISA软件筛选龙眼(Dimocarpus longan)顶芽转录组数据库序列, 从114 445条龙眼转录组unigene序列中发现11 546个SSR位点, SSR出现频率为10.09%。其中1 975条unigene含有两个或两个以上EST-SSR位点, 占所有SSR...
越橘属植物EST-SSR分子标记开发及遗传多样性分析
越橘 分子标记 EST-SSR 遗传多样性
2018/2/8
以84份越橘种质为材料, 从NCBI公共数据库下载22 402条越橘属(Vaccinium) EST序列, 通过CAP3组装软件将EST序列拼接成11 541条unigene序列, 其中2 076条unigene序列含有2 679个SSR位点。二核苷酸和三核苷酸重复是主要的SSR类型, 约占SSR总数的96.01%。利用Primer Premier 5.0软件设计81对引物, 其中55对引物在供试...
通过转录组测序技术鉴别普通油茶(Camellia oleifera) EST-SSR位点, 开发筛选适用于普通油茶种质资源评价与利用的多态性SSR标记, 对普通油茶的遗传变异研究和油茶良种的分子标记辅助育种具有重要意义。利用 MISA 工具从普通油茶转录组67 434条Unigenes (63.39 MB)中筛选得到26 751个包含1~6个核苷酸重复类型的SSR位点, SSR的分布频率为39.6...
2015年12月4日由中国科学院武汉植物园张琼副研究员、黄宏文研究员、刘春燕博士生、钟彩虹研究员、龚俊杰研究员共同发明的“用于猕猴桃杂交群体雌雄性别鉴定的SSR分子标记A003（ZL 201410523043.8）获国家发明专利授权。
利用正交试验设计优化并确立光萼荷属（Aechmea）植物SSR反应体系，构建部分光萼荷属植物的SSR分子指纹图谱。结果表明：光萼荷属植物的最佳SSR反应体系为10 μL总体积包括1×PCR buffer、Mg2+ 2.0 mmol·L-1、dNTPs 200 μmol·L-1、引物2.5 μmol·L-1、模板DNA 90 ng和Taq DNA聚合酶1.5 U。利用该体系和6对SSR引物对15份光...
禾本科芒属植物具有在边际性土地(marginal land)上驯化成为高产能源作物的巨大潜力, 其中尼泊尔芒(Miscanthus nepalensis)和双药芒(M. nudipes)两个双药芒组物种分布于喜马拉雅–横断山地区, 是具有耐寒及抗旱特性的优良种质资源。为了了解其遗传多样性和群体遗传结构，需要筛选出有效的分子标记。目前在适用于核心芒属植物群体遗传学分析的42对SSR引物中, 有23对...
Genetic Relationships between Cultivated and Wild Olive Trees (Olea Europaea L. Var. Europaea and Var. Sylvestris) Based on Nuclear and Chloroplast SSR Markers
Cultivars Oleaster Genetic Relationship SSR Markers Haplotype Origin
2010/12/28
The olive is widely cropped in Tunisia where also oleaster trees thrive all around orchards and in natural sites. Little is known on the genetic relationships between the olive crop and oleaster trees...
基于SSR标记分析小豆及其近缘植物的遗传关系
豇豆属植物 SSR 遗传多样性 遗传关系
2010/8/27
本研究利用87对SSR引物分析了80份栽培小豆(Vigna angularis)、22份野生小豆(V. angularis var. nipponensis)以及10份豇豆属(共7个种)近缘植物, 旨在比较豇豆属不同种的遗传多样性, 并分析种间的遗传关系。结果显示87对SSR引物在112份小豆及其近缘植物资源中共检测到667个等位变异, 其中有75个、71个和82个SSR位点分别在栽培小豆、野生小...
天蓝苜蓿(Medicago lupulina)隶属于苜蓿属, 是一年生或越年生、广布的草本植物。通常认为它是自交种, 但也有些研究报道它具有异交或者混合交配的繁育系统。为了了解它的居群遗传变异、基因流、繁育方式及其遗传背景, 我们用9个EST-SSR标记分析了中国新疆、内蒙古、甘肃、北京、山西、陕西、湖北7个省区的17个天蓝苜蓿野生居群。结果表明: (1) EST-SSR的多态位点百分率(PPL)...
中国板栗自然居群微卫星(SSR)遗传多样性
Castanea mollissima 种质资源 微卫星 遗传多样性 居群遗传结构
2009/9/22
采用8对微卫星分子标记对中国板栗(Castanea mollissima)的28个自然居群进行了遗传多样性与遗传结构分析。在849个个体上扩增得到128个等位基因, 每位点平均等位基因数(A)为16。中国板栗居群的平均预期杂合度(HE)为0.678, 平均观察杂合度(HO)为0.590。华中地区的中国板栗居群遗传多样性最高(A = 8.112, HE = 0.705, HO = 0.618), 其...