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微生物需要在基因转录水平上对环境变化做出响应,这对于它们在能量利用、毒力调控、进化方向乃至于工业应用上都至关重要。葡萄糖是大肠杆菌的首选碳源。早期开展的诸多关于大肠杆菌在缺乏葡萄糖生长环境中的研究表明,细胞内信号分子cAMP的水平升高能够激活cAMP受体蛋白(cAMP receptor protein,CRP)与靶标DNA的结合,不仅能调节超过7%的全局基因转录水平,还能使细菌转而利用其他非葡萄糖...
中国科大揭示双转录因子激活蓝藻硝酸盐同化通路的分子机制(图)
分子机制 解析 鱼腥蓝细菌
2024/1/7
中国科学技术大学生命科学与医学部周丛照教授课题组与中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所张余研究员课题组合作,利用冷冻电镜(cryo-EM)单颗粒重构技术,解析了鱼腥蓝细菌Anabaenasp. PCC 7120 转录激活复合物的三维结构,阐明了双转录因子以DNA looping的方式协同调控硝酸盐同化通路转录激活的分子机制,完善了细菌转录级联调控网络。该研究成果以“DNA loo...
中国科学家揭示热纤梭菌转录调控因子新机制
聚合酶 热纤梭菌 木质纤维素
2023/10/19
2023年10月13日,中国科学院生物物理研究所朱平研究团队和青岛生物能源与过程研究所冯银刚研究团队合作在《自然-通讯》发表新研究,揭示了热纤梭菌σI因子进行启动子特异识别并调控纤维小体基因转录的分子机制。
2023年03月27日,上海市免疫学研究所陈磊研究员团队在Genome Research上发表了题为“Simultaneous profiling of host expression and microbial abundance by spatial meta-transcriptome sequencing”的研究论文。该研究首次开发了空间宏转录组测序及一体化的生物信息分析技术SMT(Spa...
中国科学院研究揭示细菌固有转录终止的结构基础(图)
细菌 结构基础 分子植物
2023/1/12
2023年1月12日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心合成生物学重点实验室张余研究团队、美国威斯康辛大学麦迪逊分校Robert Landick团队与浙江大学冯钰团队合作,在《自然》(Nature)上,发表题为Structural basis for intrinsic transcription termination的研究论文。该研究捕获了细菌固有转录终止的中间状态冷冻电镜结构,揭示了细菌RN...
中国科学院分子植物科学卓越创新中心张余研究组揭示细菌固有转录终止的结构基础(图)
张余 细菌 结构基础 聚合酶识别
2023/1/12
2023年1月12日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心合成生物学重点实验室张余研究团队和美国威斯康辛大学麦迪逊分校Robert Landick团队以及浙江大学冯钰团队合作在Nature上发表题为“Structural basis for intrinsic transcription termination”的研究论文,该研究捕获了细菌固有转录终止的中间状态冷冻电镜结构,揭示了细菌RNA聚合酶识...
中国科学院深圳先进技术研究院检测转录因子结合位点的新方法(图)
检测 转录因子 单核苷酸 免疫沉淀
2022/12/27
2022年12月19日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所金帆课题组在国际学术期刊Microbiology Spectrum上发表了题为《AIDmut-Seq: A three-step method for detecting protein-DNA binding specificity》的研究成果。该研究发展了一种检测转录因子结合位点(transcription factor bi...
中国科学院深圳先进技术研究院基因组层面测量铜绿假单胞菌的转录调控噪声(图)
基因 单胞菌种群
2022/11/25
2022年11月25日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所金帆课题组在国际学术期刊mSystems上发表了题为《Genome-Wide Analysis of Gene Expression Noise Brought About by Transcriptional Regulation in Pseudomonas aeruginosa》的研究成果。团队利用成果所构建文库,在单细菌层...
中国科学院分子植物科学卓越创新中心张余研究组解析了致病菌中新型转录调控的分子机制(图)
张余 解析 分子机制 细菌厌氧
2022/7/20
铜绿假单胞菌是一种条件性致病菌,严重危害人类身体健康。最近在铜绿假单胞菌中报道一个新型的转录因子SutA(survival under transition A)。SutA对于维持细菌厌氧条件下的基因转录至关重要。SutA突变会造成各种缺陷的表型,如生物膜形成能力降低,致病毒力下降等。生化和遗传数据表明SutA调控细菌内大多数基因表达,尤其是核糖体合成相关的基因,但是其作用机制尚未得到解析。
山东大学微生物技术国家重点实验室(研究院)马翠卿、高超教授团队基于转录调控因子的乳酸生物传感器研究取得新进展(图)
山东大学微生物技术国家重点实验室(研究院) 马翠卿 高超 转录调控因子 乳酸生物传感器 微生物发酵法 乳酸
2022/6/21
山东大学微生物技术国家重点实验室(研究院)侯进教授课题组在Nucleic Acids Research发表CRISPR转录调控工具开发的新进展(图)
山东大学微生物技术国家重点实验室(研究院) 侯进 Nucleic Acids Research CRISPR 转录调控工具 酿酒酵母
2022/6/6
中国科学院微生物研究所东秀珠团队发现古菌转录终止机制(图)
中国科学院微生物研究所 东秀珠 古菌 极端微生物 转录终止 甲烷古菌 Microbiology Spectrum(2021)
2022/1/5