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Cotton Production《棉花生产》英文版于2020年由Wiley & Sons Ltd出版。中国农业科学院棉花研究所毛树春、李亚兵、王占彪、李鹏程等撰写Cotton Production in China（中国棉花生产）一章。该著由Khawar Jabran（Niğde Omer Halisdemir University, Niğde, Turkey）与Bhagi...
Expressed genes and their new alleles identification during fibre elongation reveal the genetic factors underlying improvements of fibre length in cotton
棉花 纤维伸长 表达基因簇
2023/9/18
本研究对亲本海7124、中棉所36及47个子代纤维发育5，10和15天的转录组数据分析，鉴定到35420个表达基因，构建了纤维伸长相关动态表达调控网络，其中10366个表达基因在子代中产生新等位基因（ENAs）；进一步鉴定到7个时空特异调控表达基因簇，差异表达分析筛选到105个候选基因，包含15个新等位基因。CRISPR-cas9系统敲除GhMAH1使纤维显著变短。本研究为解析陆海群体纤维长度变异...
Dynamic roles and intricate mechanisms of ethylene in epidermal hair development in Arabidopsis and cotton
棉花 乙烯 生物合成 信号转导途径
2023/9/18
团队通过系统生物信息学分析，鉴定了棉花中乙烯生物合成及信号转导途径的关键组分，并系统讨论和综述了乙烯在植物表皮毛发育中的分子机制，提出了乙烯介导的纤维发育的调控网络。
Improvement of plant tolerance to drought stress by cotton tubby-like protein 30 through stomatal movement regulation
棉花 气孔运动 GhTULP30 干旱胁迫
2023/9/18
棉花是一种重要的工业作物，逐渐转向在干旱地区种植。然而，参与植物响应各种胁迫的Tubby-like protein，TULP在棉花中很少被报道。本研究通过调节气孔运动，展示了GhTULP30对植物耐受干旱胁迫的改进。GhTULP30在酵母中的异源表达显著提高了其抗盐和干旱耐受性。GhTULP30的过表达使得拟南芥种子在种子萌发期间更加抵御干旱和盐胁迫，并且在干旱胁迫条件下提高了该植物的气孔关闭速度...
该研究发现棉花种植环节的环境影响取决于灌溉、农药和化肥用量。全球约有一半的棉田使用地下水灌溉，农药平均施用量为 1.57 kg/ha，氮磷肥平均投入量为150 kg/ha。全球各棉区灌溉、农药、氮肥施用量差异较大，经济发展水平高的地区施用量较高，而经济水平和水资源有限的棉区施用量较少，亟需因地制宜提高灌溉用水、化肥、农药利用效率，减少生产环节的环境影响。研究还发现，除了棉花种植环节对环境的影响外，...
GhAlaRP, a cotton alanine rich protein gene,involves in fiber elongation process
艾克曼棉 斯蒂芬氏棉 陆地棉野生种 基因组 结构变异
2023/9/18
本研究对艾克曼棉、斯蒂芬氏棉和一个陆地棉野生种系进行测序，解析了棉花多倍化及适应性进化过程中广泛存在的基因组结构变异，阐述了棉花生物多样性和棉花驯化的遗传基础；发现编码磷酸肽结合蛋白的基因结构变异可能与棉花纤维长度调控有关，烯酰辅酶Aδ异构酶3和RAP2-7可通过调节植物激素提高棉花非生物胁迫耐受性。研究结果揭示了棉花多倍化过程中的适应性进化机制，为棉花抗性和纤维品质遗传改良提供了宝贵的遗传材料。
The journal sets out to unite researchers conducting cotton research in agricultural, biological, bioengineering and material fields. Publications shall contribute to promote multidisciplinary develo...
在这项研究中，我们对七个优良棉花品种的PAV模式进行了综合分析，发现大部分PAV小于20kb,小于40kb的PAV总共有1.27Gb，占到整个基因组的50.7%，大于40kb的PAV共有15430个，共有1.23Gb，占到整个基因组的49.3%。基因结构分析发现大部分缺失型PAV不在内含子区域或者外显子区域，说明这些PAV可能不对基因功能起直接作用。多倍性PAV主要定位在内含子区域，并且紧邻外显子...
Non-functional GoFLA19s are responsible for the male sterility caused by hybrid breakdown in cotton (Gossypium spp.)
陆地棉 光敏雄性不育 基因控制 隐性性状
2021/9/18
陆地棉光敏雄性不育系中9106是在中040029的后代中发现的突变体，它在长日照（河南安阳）条件下表现为彻底的雄性不育。以陆地棉乐土603、TM-1和海岛棉海7124为父本分别配置F2杂交组合发现中9106的雄性不育性状是受一对核基因控制的隐性性状。利用以全基因组测序为基础的分离群体群分法和以中9106×TM-1的F2群体进行的图位克隆，将中9106的雄性不育基因定位在D12染色体上QZD84和Q...
Transcriptome and QTL analyses reveal candidate genes for fiber quality in Upland cotton
棉花 纤维发育 QTL 转录组 表达基因
2021/9/18
本研究基于前期得到的1个F2群体、1个重组自交系群体和2个永久回交群体得到了15个在多群体或者多年分稳定检测的QTL位点。基于转录组测序，在两亲本间发育10天的纤维进行差异基因鉴定，得到了780个差异基因。通过对QTL和转录组结果联合分析，在9个QTL区间内得到31个基因，其中有9个在纤维中优异表达的基因。在这9个基因中，有7个基因在纤维伸长期高量表达，2个基因在纤维次生壁加厚期高量表达。该研究为...
Examining two sets of introgression lines across multipleenvironments reveals background‑independent and stably expressedquantitative trait loci of fiber quality in cotton
陆海渐渗系 纤维品质 QTL 棉花
2021/9/18
首次利用两套陆海渐渗系鉴定纤维品质QTL，探讨遗传背景和环境对纤维品质QTL表达的影响，揭示了遗传背景对纤维品质QTL表达的影响明显大于环境因素；在全基因组上鉴定到稳定的QTLs 109个，不受背景影响的QTLs 9个。其中，61个稳定的QTLs，包括2个不受背景影响的QTLs，是新发现的；鉴定到19个含有多个纤维品质性状的优良等位基因的QTL簇，为进一步棉花分子育种提供了重要信息和理论指导。
Genome-wide quantitative trait loci reveal the genetic basis of cotton fiber quality and yield-related traits in a G.hirsutum recombinant inbred line population
0-153 sGK9708 棉花产量 品质性状
2021/9/18
利用0-153和sGK9708为亲本构建的RIL群体为材料，通过全基因组QTL挖掘明确了棉花产量及品质性状的相关性及其与QTL簇加性效应方向的关系，初步揭示了棉花产量纤维品质性状负相关形成的遗传基础，为进一步利用标记辅助选择、基因组编辑等技术同步改良棉花纤维品质和产量提供了重要的基因资源和位点信息。该研究以0-153*SGK9708为亲本构建的含有196个重组自交系群体为材料，在黄河流域及西北内陆...
EMBRYONIC FLOWER2B, coming from a stable QTL, represses the floral transition in cotton
棉花 开花机理 EMF2基因
2021/9/18
花是植物重要的器官,受到多种花发育因子的调控。了解和掌握棉花的开花机理，对育种家选育合适生育期的材料，乃至对实现分子精确设计育种的目标都是至关重要的。EMBRYONIC FLOWER 2(EMF2)是多梳家族Polycomb Repressive Complex 2（PRC2）组成的亚基之一，对花器官属性建立过程中起调控作用。通过全基因组关联分析我们定位到开花相关的QTL（q FT-D3-3和qF...
Cotton DMP gene family: characterization, evolution, and expression profiles during development and stress
棉花 DMP 基因家族 系统分析
2021/9/18
对16种植物的174个DMP基因的系统发育进行分析，这可分为5个亚家族(I-V)；4个棉种包括58个DMP基因，大部分棉花DMP主要在生殖器官(萼片、花瓣、雌蕊和花药)和次生细胞壁期纤维中表达；基因互作网络表明：DMP作为一种内膜系统参与植物衰老过程和花的生殖发育。本研究对棉花DMP基因家族进行了系统分析，探究了候选基因的潜在功能。
Detection of candidate genes and development of KASP markers for Verticillium wilt resistance by combining genome wide association study, QTL seq and transcriptome sequencing in cotton
棉花 抗黄萎病性状 关联群体 遗传分离群体
2021/9/18
构建了棉花抗黄萎病性状的关联群体和遗传分离群体，联合利用全基因组关联分析(GWAS)、QTL- Seq和转录组测序开展了棉花抗黄萎病基因发掘与KASP标记开发研究,获得了5个主效抗黄萎病QTL的候选基因区间，开发出10个可以用于陆地棉抗病性标记辅助选择育种的KASP标记，同时鉴定出8个抗黄萎病候选基因，这些基因主要参与植物基础免疫反应及广谱抗病性，推测基础免疫反应相关基因在抗、感品种间的gDNA&...