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四川麻鸭mtDNA全序列的克隆和生物信息学分析
线粒体基因组 四川麻鸭 遗传进化
2016/9/26
本研究旨在获得四川麻鸭线粒体DNA基因组全序列（mtDNA），为该遗传资源的保护与利用提供参考。研究参照近缘物种线粒体基因组序列，用Primer 6.0设计引物16对，采用PCR克隆测序技术获得四川麻鸭mtDNA基因组序列。结果表明，四川麻鸭mtDNA基因组全长16 604 bp，碱基组成为A（29.19%）、C（32.82%）、G（15.79%）、T（22.20%），包含22个tRNA基因、2个...
Application of mtDNA markers for European huchen (Hucho hucho Linnaeus, 1758) management in Poland
Salmonidae broodstocks conservation genetic structure mtDNA
2015/12/17
Four broodstocks of European huchen (Hucho hucho) from Poland, Germany, Slovakia, and Ukraine were investigated using five selected fragments of mtDNA. The mitochondrial DNA sequence analysis was succ...
鸡mtDNA D-loop区单倍型簇频率与中国家鸡多母系起源研究
家鸡 mtDNA D-loop区 单倍型 聚类分析 频率 起源
2015/12/14
本研究旨在通过分析家鸡和原鸡D-loop区单倍型簇的区域性分布和频率揭示中国家鸡多母系起源的区域和传播途径。通过对1 347条鸡D-loop序列进行完全对比排序，共发现198种单倍型，聚成12个单倍型簇。分析结果显示，海岛型红色原鸡与家鸡和大陆型红色原鸡有明显差异；苏门答腊大陆型红色原鸡作为独立分支，也体现出与东南亚大陆型红色原鸡的区别。单倍型簇频率分析显示，Clade C代表的母系可能更早在东南...
为评价现有选育方式下的遗传结构现状及选育潜力，采用mtDNA D-loop序列差异分析技术，对埃及品系尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus）的3个选育世代群体共80尾鱼开展世代间遗传结构变异分析。结果显示：1）3个世代群体中个体序列长度为552~555 bp，包括52个变异位点、12个单倍型，平均单倍型多样度（H）为0.569；2）3个世代群体的核苷酸多态性（Pi）分别为0.02...
西藏牦牛mtDNA cytb基因的序列多态性及其系统进化分析
西藏牦牛 细胞色素b基因 遗传多样性 系统进化
2012/11/26
为从分子水平上探究西藏牦牛类群的亲缘关系、分类地位和遗传多样性，本研究测定了嘉黎牦牛、桑桑牦牛、桑日牦牛、工布江达牦牛、斯布牦牛、帕里牦牛、康布牦牛、江达牦牛、类乌齐牦牛、丁青牦牛、巴青牦牛等11个西藏牦牛类群共110头牦牛的细胞色素b基因全序列，分析了其多态性，并构建了11个类群的系统进化树。结果表明：11个西藏牦牛类群的细胞色素b基因全序列长均为1 140 bp，共有单倍型53种，其中新发现的...
Sequence analysis of the mtDNA region correlated with Shaan 2A cytoplasmic male sterility in rapeseed (Brassica napus L.)
cytoplasmic male sterility (CMS) marker-assisted selection (MAS) orf224-1 rapeseed (Brassica napus L.) Rf-restorer gene Shaan 2A CMS line
2012/2/25
Until now in Europe has not been cultivated any hybrid cultivar of oilseed rape based on the Shaan 2A cytoplasmic male sterility (CMS), a widely used CMS system in China. The aim of Czech breeders now...
家鸭、媒鸭和野鸭mtDNA D-loop区的遗传变异
鸭 D-loop 遗传多样性 系统进化
2011/9/23
旨在从mtDNA水平探讨我国家鸭的遗传多样性及家鸭与野鸭间的亲缘关系。运用DNA测序方法，测定了不同地域、水域和表型性状的9种家鸭（北京鸭、高邮鸭、巢湖鸭、绍兴鸭、连城白鸭、吉安红毛鸭、文登黑鸭、云南麻鸭、建昌鸭）80个个体、4 种媒鸭（西湖野鸭、钱江野鸭、枞阳媒鸭、媒头鸭）26个个体和斑嘴鸭8个个体，共计114个个体的mtDNA Dloop区 667 bp序列。9种家鸭单倍型多样度和核苷酸多样...
中国绵羊品种mtDNA遗传多态性与系统进化研究
中国绵羊品种 mtDNA遗传多态性 系统进化研究
2011/7/15
本研究检测了中国8个地方绵羊品种和2个外来品种共计93只绵羊个体的mtDNA D-loop高变区，获得了63种单倍型，73个变异位点，其中单一多态位点30个，简约信息位点43个，除了缺失和插入位点外，还包括22处碱基转换和1个碱基颠换，转换和颠换之比为14.8；通过系统发育树分析，中国绵羊mtDNA D-loop单倍型序列聚类成A、B、C三大支系，表明了中国现代绵羊品种存在3个母系起源，且第三个起...
采用PCR技术对12条绵阳市野生黄鳝mtDNA D-loop区部分序列进行扩增和测序，对所得9个个体606 bp的核甘酸片段序列进行遗传变异和系统进化分析：9条野生黄鳝D-loop序列的四种核苷酸组成中，T和C的组成频率为固定值，而A和G的频率有一定的差异；A+T的平均组成频率(57%)显著高于C+G的频率(43%)。从9条D-loop序列中一共检测到了5个多态位点，占总核苷酸序列总数(606 b...
为了从分子水平鉴别三例同核异质小麦雄性不育材料，利用RAPD技术，对细胞核来自同一普通小麦(Triticum aestivum)，细胞质分别来自粘果山羊草(Aegilops kotschyi)、二角山羊草(Ae.bicornis)和斯卑尔脱小麦变种(T.spelta)的三例同核异质小麦雄性不育系的线粒体DNA(mtDNA）进行差异片段的比较分析。结果表明:（1）三种不育系在mtDNA上呈现明显差异...
为了从分子水平鉴别三例同核异质小麦雄性不育材料，利用RAPD技术，对细胞核来自同一普通小麦(Triticum aestivum)，细胞质分别来自粘果山羊草(Aegilops kotschyi)、二角山羊草(Ae.bicornis)和斯卑尔脱小麦变种(T.spelta)的三例同核异质小麦雄性不育系的线粒体DNA(mtDNA）进行差异片段的比较分析。结果表明:（1）三种不育系在mtDNA上呈现明显差异...
中国斗鸡mtDNA遗传多样性及起源研究
斗鸡 细胞色素b 遗传多样性
2009/11/3
本研究旨在探究中国斗鸡的遗传多样性和起源。运用DNA测序的方法测定了河南斗鸡、鲁西斗鸡、吐鲁番斗鸡、西双版纳斗鸡和漳州斗鸡5个斗鸡品种40个个体的mtDNA细胞色素b（Cytb）的部分碱基序列(535 bp)。结果表明，这5个斗鸡品种共有6种单倍型；单倍型多样度为0.428 57～0.785 71；核苷酸多样度为0.000 80～0.006 54；漳州斗鸡与其它斗鸡的遗传距离均较远；基于单倍型构建...
本研究旨在分析mtDNA ND4基因在中国西南马的遗传多样性。对中国西南马6个品种（类群）142个个体的线粒体DNA ND4基因部分序列进行PCRSSCP和序列分析。结果表明，拼接后的西南马mtDNA ND4 基因序列大小为679 bp，A+T含量（55.7%）高于G+C含量（44.3%）。共检测到11个核苷酸变异位点，这些变异位点可归纳为6种单倍型。核苷酸平均多样度为0.638%，表明受试西南...
云南文山黄牛mtDNA D-loop区遗传多样性分析
云南文山 黄牛 mtDNA D-loop区 遗传多样性
2009/10/21
云南文山黄牛mtDNA D-loop区遗传多样性分析。