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鸡mtDNA D-loop区单倍型簇频率与中国家鸡多母系起源研究
家鸡 mtDNA D-loop区 单倍型 聚类分析 频率 起源
2015/12/14
本研究旨在通过分析家鸡和原鸡D-loop区单倍型簇的区域性分布和频率揭示中国家鸡多母系起源的区域和传播途径。通过对1 347条鸡D-loop序列进行完全对比排序，共发现198种单倍型，聚成12个单倍型簇。分析结果显示，海岛型红色原鸡与家鸡和大陆型红色原鸡有明显差异；苏门答腊大陆型红色原鸡作为独立分支，也体现出与东南亚大陆型红色原鸡的区别。单倍型簇频率分析显示，Clade C代表的母系可能更早在东南...
为评价现有选育方式下的遗传结构现状及选育潜力，采用mtDNA D-loop序列差异分析技术，对埃及品系尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus）的3个选育世代群体共80尾鱼开展世代间遗传结构变异分析。结果显示：1）3个世代群体中个体序列长度为552~555 bp，包括52个变异位点、12个单倍型，平均单倍型多样度（H）为0.569；2）3个世代群体的核苷酸多态性（Pi）分别为0.02...
家鸭、媒鸭和野鸭mtDNA D-loop区的遗传变异
鸭 D-loop 遗传多样性 系统进化
2011/9/23
旨在从mtDNA水平探讨我国家鸭的遗传多样性及家鸭与野鸭间的亲缘关系。运用DNA测序方法，测定了不同地域、水域和表型性状的9种家鸭（北京鸭、高邮鸭、巢湖鸭、绍兴鸭、连城白鸭、吉安红毛鸭、文登黑鸭、云南麻鸭、建昌鸭）80个个体、4 种媒鸭（西湖野鸭、钱江野鸭、枞阳媒鸭、媒头鸭）26个个体和斑嘴鸭8个个体，共计114个个体的mtDNA Dloop区 667 bp序列。9种家鸭单倍型多样度和核苷酸多样...
采用PCR技术对12条绵阳市野生黄鳝mtDNA D-loop区部分序列进行扩增和测序，对所得9个个体606 bp的核甘酸片段序列进行遗传变异和系统进化分析：9条野生黄鳝D-loop序列的四种核苷酸组成中，T和C的组成频率为固定值，而A和G的频率有一定的差异；A+T的平均组成频率(57%)显著高于C+G的频率(43%)。从9条D-loop序列中一共检测到了5个多态位点，占总核苷酸序列总数(606 b...
云南文山黄牛mtDNA D-loop区遗传多样性分析
云南文山 黄牛 mtDNA D-loop区 遗传多样性
2009/10/21
云南文山黄牛mtDNA D-loop区遗传多样性分析。
太湖鲢鱼mtDNA D-loop区遗传多样性
鲢鱼 mtDNA D-loop区 遗传多样性
2009/7/20
采用聚合酶链式反应(PCR)技术对太湖鲢鱼的mtDNA D-loop序列进行扩增，获得了大小约为500 bp的扩增产物。PCR产物经纯化后克隆到pMD19-T Vector进行序列鉴定测序，得到了520 bp的核苷酸片段(除去引物及部分端部序列)。用CLUSTAL X(1.83)软件进行排序比较，在30个个体中，共检测到52个变异位点，包括1个碱基缺失、36个转换位点、15个颠换位点及1个转换与颠...
中国7个绵羊品种mtDNA D-loop区序列的系统发育与起源研究
绵羊 线粒体DNA 控制区 起源
2008/8/21
为探讨中国绵羊的起源、进化及遗传多样性，对新疆、内蒙古、西藏、云南、宁夏、山东等地区7个地方绵羊品种和1个外来品种共59个体的线粒体D-loop全序列进行了测序分析。7个地方绵羊群体的单倍型多样度（Hd）和核苷酸多样度（π）分别平均为0.996 0和0.030 6，表明我国地方绵羊品种的控制区遗传变异丰富。系统发育和网络进化分析均将中国绵羊分为3个明显的支系，揭示中国绵羊存在3个独立的母系起源；并...
对我国10个地方水牛品种110个个体的mtDNA D-loop区序列（930 bp左右）进行分析，共检测到50种单倍型，107个核苷酸多态位点，其单倍型多样度(Haplotype diversity, Hd)为0.895 2±0.024 0，核苷酸多样度(Nucleotide diversity, π)为0.020 0±0.005 6，平均核苷酸差异(Average number of nucle...
中国家驴mtDNA D-loop遗传多样性与起源研究
中国家驴 mtDNA D-loop 遗传多样性 起源
2008/3/24
对我国12个家驴品种126个个体（包括引用26个个体）的mtDNA D-loop 区399 bp进行分析，共检测到36种单倍型37个多态位点，其单倍型多样度为0.466 7~0.977 8，核苷酸多样度为0.001 2~0.028 5，表明我国家驴的遗传多态性丰富。与3条努比亚野驴、3条索马里野驴和6条亚洲野驴的序列构建 NJ系统发育树，首次证明我国家驴的母系起源为非洲野驴中的索马里驴和努比亚驴，...
藏羚羊mtDNA D-Loop区遗传多样性研究
藏羚羊 线粒体D-loop区 单倍型 遗传多样性
2007/12/21
该研究采用非损伤性DNA基因分型技术，对可可西里地区10个藏羚羊（Pantholops hodgsonii）个体的mtDNA非编码区部分片段（444~446bp）进行了序列分析，结果显示A、T%含量（61.8%）明显高于G、C%含量（38.2%），共发现10种单倍型，包括48个多态位点，其中转换位点44个、颠换位点1个、插入位点1个、缺失位点2个。单倍型间平均遗传距离为0.031，单倍型多态性（h...
摘要对贵州4个地方黄牛品种共计82个个体的线粒体DNA D-loop区全序列910 bp进行分析，检测到31种单倍型，其核苷酸多态位点65个，约占所测核苷酸总长的7.14%，其中有62个转换，2个颠换，1个转换/颠换共存。贵州4个黄牛品种mtDNA D-loop区核苷酸多样度（π值）为2.16%～2.61%，单倍型多样度（H）为0.695～0.909，表明贵州黄牛mtDNA遗传多样性比较丰富。根据...
我国主要地方绵羊品种mtDNA D-loop区PCR-RFLP研究
地方绵羊品种 线粒体DNA D-loop PCR-RFLP
2007/12/21
摘要利用5种限制性内切酶（Hinf I，Msp I，Sau3A I，Xsp I，Taq I），采用PCR-RFLP技术研究了我国9个地方绵羊品种以及2个引入品种共计83只绵羊个体线粒体DNA D-loop区的多态性。结果表明，我国主要地方绵羊品种线粒体DNA D-loop区存在两种基本单体型，提示我国主要地方绵羊品种起源于两个母系祖先。线粒体DNA D-loop区多态度为0.042 1%，说明我国...
中国家驴mtDNA D-loop遗传多样性与起源研究
中国家驴 mtDNA D-loop 遗传多样性 起源
2006/7/26
对我国12个家驴品种126个个体（包括引用26个个体）的mtDNA D-loop 区399 bp进行分析，共检测到36种单倍型37个多态位点，其单倍型多样度为0.466 7~0.977 8，核苷酸多样度为0.001 2~0.028 5，表明我国家驴的遗传多态性丰富。与3条努比亚野驴、3条索马里野驴和6条亚洲野驴的序列构建 NJ系统发育树，首次证明我国家驴的母系起源为非洲野驴中的索马里驴和努比亚驴，...