搜索结果: 1-15 共查到“兽医科学基础学科 SNP”相关记录18条 . 查询时间(0.296 秒)
武汉市农业科学院专利：与中国南方荷斯坦奶牛产奶性状相关的SNP标记及其应用。
旨在研究马身猪保种群体的遗传多样性、亲缘关系和家系结构。本研究利用Illumina CAUPorince 50 K SNP芯片检测39头保种马身猪的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）；采用Plink软件计算最小等位基因频率、多态信息含量、观察杂合度和期望杂合度，分析保种群体的遗传多样性；采用Plink软件构建状态同源（identity by st...
利用猪1.4M高密度SNP芯片检测巴马香猪全基因组拷贝数变异
巴马香猪 拷贝数变异 1.4M高密度SNP芯片
2020/1/31
旨在检测巴马香猪基因组上的拷贝数变异（CNV），并探究标记密度对于CNV检测效率和准确率的影响。本研究利用319头巴马香猪（其中阉公猪160头和母猪159头）1.4M高密度SNP芯片的数据，采用PennCNV和R-Gada两种软件进行CNVs检测；然后通过重叠CNV融合法，构建拷贝数变异区域（CNVR），并用全基因组关联分析（GWAS）对频率大于5%的CNVR进行验证；最后根据不同的标记密度，均匀...
狼山鸡NLRC5基因启动子区SNP及其在先天免疫中的效应分析
鸡 NLRC5基因 多态性 先天免疫
2015/1/26
旨在通过检测狼山鸡NLRC5基因启动子区单核苷酸多态位点，确定不同基因型的遗传效应，并经过后代分离群体验证，以期筛选与先天免疫性状相关的遗传标记。本研究采用MALDI-TOF-MS技术对狼山鸡群体NLRC5基因启动子区SNPs位点进行扫描；同时测定部分免疫性状，分析不同基因型个体免疫性状的差异。结果发现，在g.628981处存在A/G突变，共AA、AG和GG 3种基因型，狼山鸡不同基因型免疫指标间...
安徽地方猪TLR4基因第3外显子的SNP分析
安徽地方猪 TLR4基因 单核苷酸多态性 群体遗传学分析
2014/3/27
本试验采用 PCR-SSCP 方法对皖南黑猪、圩猪、安庆六白猪、霍寿黑猪及长白猪5个群体共354个样本TLR4基因外显子3部分片段的遗传变异进行了检测，旨在系统分析安徽地方品种猪TLR4基因的多态性，为探讨该基因在免疫和防御系统中发挥的作用提供依据。结果检测到2个突变：G417A、C1027A，其中，G417A为非错义突变，仅在皖南黑猪、圩猪和安庆六白猪群体中检测到，且只检测到GG、GA 两种基因...
旨在探讨鸡16号染色体SNP单倍型和拷贝数变异（Copy number variation，CNV）对血清IgG含量的影响。采用鸡60 K SNP芯片对995只北京油鸡进行分型，同时测定80日龄IgG含量。分别采用PennCNV、Haploview 4.1和PHASE 2.0软件对拷贝数变异、连锁不平衡、单倍型分析及与IgG的关联分析。结果发现，该区域存在2个单倍型块和2个拷贝数变异区。Block...
试验借助高密度SNP芯片技术在整个基因组范围内对223头中国西门塔尔牛群体进行基因分型，在SCD1基因上发现7个SNPs位点，对各SNP位点与西门塔尔牛肉质性状进行相关性分析。结果表明， SCD1基因的7个SNPs位点均与大理石花纹等级显著相关（P<0.05或P<0.01）； A10050C、A13655G、C14790T和A15565G 4个位点对剪切力影响显著(P<0.05)；位点A13655...
本研究旨在比较微卫星标记和单核苷酸多态（SNP）标记进行奶牛亲子鉴定的效率。研究中随机模拟了10 000对含微卫星或SNP标记信息的非亲子关系的个体，用排除法进行亲子鉴定，该过程重复100次。结果表明，标记的多态性对于排除概率的影响最大。达到同样的排除概率，所需低多态标记数量远高于高多态标记。当真实母亲基因型已知时，个体父亲的推断效率较高。达到同样的排除概率，无论标记多态性高或低，3种鉴定类型所需...
利用半定量RT-PCR方法，对MyoT基因在白来航鸡7种不同组织（心、肝、脾、肺、肾、脑和肌肉）中的表达谱进行研究。结果表明，MyoT基因只在心脏和肌肉中表达。克隆得到了鸡MyoT基因的部分片段，发现外显子10存在A/G转换，利用PCR-Hin6Ⅰ-RFLP方法对其在12个中国地方鸡种（白耳鸡、仙居鸡、大骨鸡、鹿苑鸡、固始鸡、斗鸡、乌骨鸡、油鸡、茶花鸡、萧山鸡、狼山和藏鸡）和1个外来鸡种（隐性白羽...
藏鸡和隐性白羽鸡GH基因的SNP检测及其与生长性状间的关联分析
藏鸡和隐性白羽鸡 SNP M-ASP GH基因Intron4 生长性状 关联分析
2008/10/21
利用改良等位基因特异性PCR（Modified Allele Specific PCR, M-ASP）结合PCR-RFLP以及直接测序方法对藏鸡和隐性白羽鸡生长激素（Growth Hormone, GH）基因内含子4 （Intron4）的一个位点进行了SNP检测，并进行了该基因与藏鸡生长性状的关联分析。检测结果显示，GH基因Intron4的这个位点同时具有M-ASP和SacI-RFLP多态。测序结...
采用PCR-RFLP方法对新发现的一引起氨基酸改变的SNP位点(读码框第722位碱基)进行了检测，初步探讨了DQA基因作为影响经济性状候选基因的可能性。经在6个中国地方猪种及大白猪中PCR-RFLP检测，发现除小梅山和大白猪外，其它几个猪种均存在多态性,同时对6个地方猪种间的基因型频率的差异进行了χ2检验。在通城猪、长白猪、大白猪及其三元杂种猪长大通和达长通猪中检测了该位点的基因型，并运用GLM进...
外显子16是鸡lmbr1基因最大的外显子，本研究进行了该外显子在丝羽乌骨鸡和白洛克肉鸡间的SNP检测和单倍型分析。研究表明，鸡lmbr1 外显子16 的PCR-SSCP基因型在两个品种间的分布存在明显差异，测序从24个个体中检测到4个变异位点，其中T32C变异在两个品种间存在明显差异，丝羽乌骨鸡均含有32T（纯合的TT或杂合的TC），白洛克肉鸡在T32C位点都为纯合的CC；单倍型分析从24个个体中...
克隆了鸡Camk2d基因的部分片段并发现Camk2d基因第15外显子51bp处有一C→T碱基转换的沉默突变，该突变位点具有VspI酶切多态，通过PCRRFLP技术对我国乌骨鸡、鹿苑鸡、固始鸡、白耳鸡、仙居鸡、斗鸡和大骨鸡等7个不同地方品种鸡进行了基因型检测。结果表明：在7个品种中存在3种基因型（CC、CT、TT），χ2检验显示在各品种间基因型存在不同差异。同时在藏鸡，隐性白羽鸡，杂交鸡(藏♂×隐...
根据腺苷琥珀酸裂解酶（adenylosuccinate lyase, ADSL）基因外显子9的序列设计引物，用PCR-SSCP的方法对隐性白羽鸡、丝羽乌骨鸡、萧山鸡、白耳鸡、藏鸡进行了单核苷酸多态性分析，并检测到了多态性，表现为3种基因型，对两种纯合子进行直接测序，结果发现9 839位碱基发生了突变，由C突变为A，将核苷酸序列翻译成氨基酸序列后，发现突变后引起ADSL基因第273位氨基酸由Pro...