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DNA右手双螺旋结构的提出开启了分子生物学新篇章1。事实上，除右手双螺旋结构外，还存在其他非经典DNA构象，如三链体DNA（triplex DNA）。三链体DNA是由单链DNA通过胡斯坦氢键（Hoogsteen hydrogen bonds）与双链DNA的大沟特异性结合形成的一种三链结构2。该结构在基因组中广泛分布，发挥重要的基因调控作用，并可导致基因组不稳定性。基于以上功能，三链体形成寡核苷酸（...
近日，上海科技大学生命科学与技术学院孙博课题组与广州医科大学附属妇女儿童医疗中心李卫课题组合作在国际学术期刊《自然-通讯》（Nature Communications）在线发表题为“RPA transforms RNase H1 to a bidirectional exoribonuclease for processive RNA-DNA hybrid cleavage”（RPA转变RNase...
中国科学院动物所等开发出低DNA用量、无扩增的PacBio建库技术（图）
动物 基因 检测
2024/7/18
基因组信息在生命科学研究中具有重要价值。基于三代长读长的测序组装越来越广泛地应用于基因组学研究。其中，PacBio高保真测序技术因高精度的测序质量被认为是三代测序的金标准。然而，PacBio标准建库方法需要大量DNA输入，限制了其在小型昆虫或珍稀样本中的应用。DNA扩增虽然可以降低样本输入量，但会引入扩增偏好和人工嵌合序列等错误，影响基因组的完整性以及变异检测的准确性。因此，亟待开发低DNA用量、...
基因组信息在生命科学研究中具有重要价值。随着价格的下降，基于三代长读长的测序组装越来越广泛地应用于基因组学研究(Nat Methods 2022;Nat Rev Gene 2024)；其中，PacBio高保真（High-fidelity,HiFi）测序技术因其高精度的测序质量被认为是三代测序的金标准。然而，其标准建库方法需要大量DNA输入（>1 μg），限制了其在小型昆虫或珍稀样本中的应用(Pro...
2024年7月4日，国际学术期刊Nature Methods在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）陈玲玲研究组关于CRISPR-dCas12a应用于DNA活细胞标记的最新研究进展：“CRISPR array-mediated imaging of non-repetitive and multiplex genomic loci in living cells”...
2024年6月27日，微生物技术国家重点实验室主任、德国国家工程院院士、欧洲科学院院士张友明受邀做客鳌山讲坛，作题为“DNA重组工程技术的创新及应用”的专题报告。青岛校区党工委副书记宋作标主持报告会。
提速2倍！DNA比对新算法研发成功（图）
DNA比对 新算法 研发成功
2024/6/13
近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所农业基因组学技术研发与应用创新团队提出DNA比对新算法，并研发出DNA比对软件“BSAlign”。相比同类并行算法，新算法能够更快生成最优比对结果，且准确度更高。相关研究成果发表在《基因组蛋白质组与生物信息学报（Genomics, Proteomics & Bioinformatics）》上。
国家自然科学基金委员会中国学者在DNA转座子多样性研究和基因工程技术开发方面取得进展（图）
基因工程 细胞 遗传 元件
2024/6/13
在国家自然科学基金项目（批准号：32325014）等资助下，中国科学院动物研究所张勇课题组与王皓毅课题组开展合作研究，在DNA转座子多样性研究和基因工程技术开发方面取得进展。研究成果以“人源细胞130个DNA转座子的异源性调查揭示其功能多样性并扩展基因工程技术工具箱（Heterologous survey of 130 DNA transposons in human cells highligh...
自1948年Barbara McClintock首次报道转座子以来1，这类跳跃遗传元件对宿主演化的重要意义逐渐被揭示2-5。其中，DNA转座子作为主要类型之一，长期以来备受关注。然而，由于以往多为个案研究，DNA转座子活性的决定因素与进化模式的一般规律尚不清晰。不仅如此，尽管DNA转座子可作为基因工程工具用于插入诱变或转基因载体6,7，但目前只有Sleeping Beauty（SB）等少数几种转座...
中国水产科学研究院珠江所对鱼类DNA 条形码数据库的开发取得进展（图）
数据 基因 种质资源
2024/6/5
2024年6月5日，珠江水产研究所观赏渔业研究室在国际学术期刊《Database》（JCR 1区，IF2022=5.8）在线发表“CoSFISH: a comprehensive reference database of COI and 18S rRNA barcodes for fish”的研究论文。该研究得到了中国-东盟海洋合作基金（CAMC-2018F）、2022年省级乡村振兴战略专项种业...
本发明提供了一种以RNA介导的特异性突变FecB基因获得基因编辑绵羊的方法及其专用sgRNA和Oligo DNA，能够特异的靶向修饰绵羊FecB基因的系统包括两个sgRNA和三个Oligo DNA序列，其中，两个所述sgRNA为sgRNAFecB？1和sgRNAFecB？2，为序列表的序列3和4的核苷酸所示的RNA或具有该序列的RNA；三个所述Oligo DNA序列为序列表的序列5、6和7或具有该...
中国科学院华南植物园关于植物DNA甲基化的调控研究获进展
植物 蛋白质 遗传
2024/5/31
DNA甲基化是表观遗传修饰的重要组成部分，可以通过改变染色质的结构、DNA的稳定性以及DNA和蛋白质的结合程度调控基因表达。在植物DNA甲基化的建立和维持过程中，植物特有的RNA聚合酶V（Pol V）通过转录出的非编码RNA招募一系列下游因子以实现对DNA的甲基化。目前，以Pol V为核心的DNA甲基化复合体已被鉴定出多个组分成员，但作为复合体核心Pol V的转录行为如何调控却不清楚。此外，鲜有关...
本发明提供了一种发夹状的接头以及利用所述发夹状接头同时检测DNA甲基化和单核苷酸变异的方法，属于基因变异检测和表观遗传修饰检测技术领域；所述接头具有如SEQ ID No.1所示的核苷酸序列，所述发夹状接头的5’至3’方向3位和4位上的胞嘧啶是甲基化修饰的胞嘧啶。所述方法包括以下步骤：基因组DNA片段化后进行末端修复加A尾，连接所述的发夹状接头和甲基化测序接头，重亚硫酸盐转化，PCR扩增，收集扩增产...
本发明提供了一种用于鉴别冬虫夏草原产地的DNA条形码组合物，所述DNA条形码组合物为代表冬虫夏草的不同原产地的CO1基因的片段。本发明提供了所述DNA条形码组合物及其扩增引物在鉴别冬虫夏草的原产地中的应用。本发明还提供了一种用于鉴别冬虫夏草的原产地的方法。本发明基于冬虫夏草菌寄主蝙蝠蛾幼虫迁移能力弱，且分布地仅限我国高海拔区域的特点，建立了一套简单、快速、易操作的鉴别冬虫夏草原产地的方法。
本发明公开了一种生产南极假丝酵母脂肪酶B的方法及其使用的特异DNA分子，特异DNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO : 3所示。实验证明，采用重组质粒pET30a？CALB原核表达CALB包涵体，再经过复性，得到高纯度(95％以上)、高活性的CALB蛋白；1L培养液约获得CALB蛋白的酶活力为21252U，比活力约253U/mg；远远高于现有文献制备的CALB蛋白的比活力。由此可见，本发明显著...