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因芯片数据分析的目的就是从看似杂乱无序的数据中找出它固有的规律, 本文根据数据分析的目的, 从差异基因表达分析、聚类分析、判别分析以及其它分析等角度对芯片数据分析进行综述, 并对每一种方法的优缺点进行评述, 为正确选用基因芯片数据分析方法提供参考.
基因表达谱芯片筛选双环醇作用HepG2细胞后的差异表达基因
基因表达谱芯片 筛选 双环醇作用 HepG2细胞
2009/7/29
目的: 应用基因表达谱芯片技术了解双环醇在肝细胞中可能上调或下调的基因，了解其可能的调节功能线索.方法: 以双环醇处理HepG2细胞，同时以二甲基硫氧化物(DMSO)处理的相同细胞系作为对照; 24 h后制备细胞裂解液，提取mRNA.应用基因表达谱芯片技术对差异表达mRNA进行检测和分析.结果: 经基因表达谱芯片分析，12种基因的表达水平上调，9种基因的表达水平下调.结论: 筛选到的一些与细胞周...
基因芯片检测乙醇对慢性乙型肝炎患者乙肝病毒多位点基因突变的研究
肝炎病毒 乙型 基因突变 乙醇
2009/6/3
目的：研究乙醇对HBV DNA多位点基因变异的影响，为慢性乙型肝炎的临床诊断和治疗提供依据。方法:选取85例慢性乙肝患者为研究对象，分为嗜酒组和非嗜酒组，采用DNA芯片技术, 检测HBV DNA前C区G1896A及A1814C位点、BCP区 A1762T及G1764A位点、P区C528A及T552C位点的基因突变。结果:嗜酒组在BCP区A1762T及G1764A位点的突变频率明显高于非嗜酒组(均P...
主要内容：1.筛选并确定老年性痴呆异常表达基因；2.研制用于针刺穴位、中药筛选的芯片；3.建立MT1和MTmRNA表达的定量分析条件；4.用Northem杂交方法研究快速老化鼠脑MTmRNA的表达，了解MT在脑老化进程中的生理和病理学作用；5.了解针刺对脑MTmRNA表达的影响。项目意义：1.老年性痴呆是国际医学界的难题，目前无理想的诊断方法和治疗药物；2.老年性痴呆属多基因协调作用的生命过程，针...
基因芯片技术在人线粒体遗传研究中的应用
基因芯片 线粒体DNA 突变 基因表达
2008/10/15
线粒体携带除核DNA外的遗传物质线粒体DNA。由于线粒体DNA的多拷贝，随细胞分裂的随机性，造成了非严谨性的遗传特性。研究发现，线粒体编码的13个多肽在电子传递链中发挥重要作用，同时也可能直接影响细胞的分裂和增殖。因此，线粒体的功能异常可引起许多与能量代谢相关的疾病，称之为线粒体相关性疾病。基因芯片技术可同时检测成千上万个基因的突变和差异表达情况，为我们全面研究线粒体遗传功能规律提供了条件和可能性...
背景与目的： 研究N-甲基-N'-硝基-N-甲基亚硝基胍(N-methy-N'-nitro-N-nitrosoguandine,MNNG)诱致小鼠胚胎畸形肢体基因表达的变化,筛选肢体畸形相关基因。 材料与方法： 应用含有8 192条小鼠基因的cDNA表达谱芯片，对MNNG诱致的孕14 d胎鼠畸形肢体组织及正常肢体组织的基因表达谱进行分析。 结果： 畸形肢体组织共筛到差异表达基因287条，其中下调2...
用于基因表达或疾病论断的DNA芯片系统
基因表达 基因芯片 诊断试剂盒
2008/8/28
生物芯片能广泛应用于疾病诊断和治疗、药物筛选、农作物优育优选、国防、航天、司法鉴定、食品卫生的环境监测等领域，它将给下个世纪的生物学、化学、药学和医学等领域带来一场革命性的变革。该项目的研究成果《可单点选通式微电磁单元阵列芯片、电磁生物芯片及应用》、《高通量电旋转检测的装置和方法》等专利已在国内和国际上申请了专利保护。电磁生物芯片的专利以技术入股的方式在美国组建腾隆公司，该项目已进入了“863”计...
RNAi及DNA芯片分析肝癌细胞系中受DNMT3B调控的下游基因
甲基转移酶 DNA甲基转移酶3B RNA干扰 肝癌
2008/1/31
摘要为揭示DNA甲基转移酶3B（DNMT3B）在肝癌中是否参与了肿瘤的发生，应用Western blotting及细胞免疫化学方法分析DNMT3B蛋白在人的正常肝细胞株、肝癌癌旁细胞株及肝癌癌细胞株中的表达。构建了DNMT3B 的RNAi稳定表达的重组载体，并转染入肝癌细胞株SMMC-7721中。以半定量RT-PCR及Western blotting分别鉴定DNMT3B RNAi表达载体对内源性D...
用基因芯片筛选高转移卵巢癌细胞系转移相关基因
卵巢癌细胞株 转移相关基因表达谱 染色体定位 分子功能
2008/1/24
摘要用标准化的Affymetrix公司生产U133A基因芯片技术研究高(H)转移卵巢癌细胞株(HO-8910PM)和正常卵巢上皮(C)基因表达谱差异, 筛选与卵巢癌转移相关的基因及其在染色体的定位和功能。结果发现高转移卵巢癌细胞株和正常卵巢上皮比较表达差异8倍以上共有1,237个基因, 其中表达上调 (信号比的对数值SLR≥3) 有597个, 表达下调 (SLR ≤-3) 有 640个。从表达差异...
基因芯片技术在新基因发现中的应用
基因芯片 新基因 应用
2007/12/19
摘要 基因芯片技术是上世纪中期在生命科学领域中发展起来的一种分子生物学新兴技术，是多学科的交叉融合。文章简单介绍了该技术的产生、原理、特点、制作方法和类型，并对其在新基因发现中的应用做一综述
基于连接检测反应的基因芯片分型技术的建立
基因芯片 连接检测反应 分型
2007/11/5
摘要 目的 建立基于连接检测反应的基因芯片分型技术。方法 将连接检测反应，通用芯片技术及片基异硫氰基化从头活化方法相结合。结果 应用测序技术验证，该方法分型准确性达到100%。另外也不会产生非模板依赖性信号，对未纯化模板的分型效果也较好。结论 连接检测反应能够在高温下进行，显著减少了探针非特异性连接；其通用性使得研究者可基于一张芯片自由选择所研究的位点，无需针对每一组探针进行操作条件的单独优化，并...
DNA芯片技术用于贝母的基因分型和种类鉴别
DNA芯片 基因型检测 贝母 种类鉴别
2002/3/22
目的通过对贝母几个种遗传多态性的研究来开发在分子水平上用于鉴别贝母基因型及不同种类的DNA芯片技术。方法用PCR扩增法和DNA直接测序法确定核苷酸多态性,用DNA芯片进行基因检测。结果首先提取来自多种贝母根茎的基因组DNA,对26S rDNA基因D2与D3区的多态性片段进行扩增和测序,然后将不同种属多态性片段的特异性寡核苷探针点置于经多聚赖氨酸处理包被的芯片。用来自不同种贝母的荧光素标记的PCR产...